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1996 Premio Ricardo Caruncho: Accésit a Alejandro Navarro, Ana Gallego, José Lesta, Miguel Pedrero y Manuel Carballal por Recopilación y análisis de la casuística ocurrida en el noroeste español durante el período del 11/95 a 3/96. Accésit a Ángel Carretero Olmedo por Las Medianas: verdad o mentira a medias.		1997 Premio Ricardo Caruncho: Accésit a Joan Plana Crivillén por Ovnis fantasmas: los que nunca existieron. Premio Cuadernos de Ufología: Revista Anomalia de CNIFO en Oporto (Portugal). Beca Universitas: Martí Flò García por Análisis bibliométrico de trabajos ufológicos publicados en revistas científicas.		1998 Premio Ricardo Caruncho: Juan Antonio Fernández Peris por Aterriza como puedas. Premio Cuadernos de Ufología: Pere Redón Trabal, presidente del CEI. Beca Universitas: José María González Infante por Análisis y ordenación del legado epistolar de Manuel Osuna Llorente. Premio Internacional Zurich: Erling Strand por la investigación desde 1984 de los sucesos de Hessdalen (Noruega).
1999 Premio Internacional Zurich: Ex aequo a Martin S. Kottmeyer por Transmutaciones. Un catálogo de temas nucleares en la mitología OVNI y a Stefania Genovese por La Mitopoyesis ufológica. Premio Cuadernos de Ufología: Joaquín Abenza Moreno y su programa de radio El último peldaño. Fondo Ricardo Caruncho: José Juan Montejo Aguilera por su proyecto de investigación sobre un supuesto encuentro cercano de 1938. Beca Universitas: Antonio Calzada Sáinz, para el desarrollo informático de la Base de Datos de la Cultura Ufológica.		2000 Premio Internacional Zurich: José Miguel Alcíbar Cuello por El Condesito: Un viaje al corazón del fenómeno Ovni. Premio Cuadernos de Ufología: La revista británica Magonia. Beca Universitas: Ignacio Cabria García, por su propuesta de trabajo La Ufología y las Ciencias Sociales.		2001 Premio Cuadernos de Ufología: La revista chilena La nave de los locos, en la persona de Diego Zúñiga Contreras. Fondo Ricardo Caruncho: Marcos Benítez Campillo (Proyecto CREBE) Antonio Salinas (SIB) Juan Carlos Victorio Carlos León. Beca Universitas: Manuel Borraz Aymerich, por Hidroaerolitos: el enigma que cayó del cielo.
2002 Premio Internacional Zurich: Ángel Carretero Olmedo, por la investigación sobre el caso de Los Bateles-Conil (Cádiz). Premio Cuadernos de Ufología: La revista británica European Journal of UFO and Abduction Studies, en la persona de Craig Roberts. Fondo Ricardo Caruncho: Ignacio Cabria García, por la ordenación de los archivos de prensa santanderinos. Beca Universitas: Jaime Servera Alcaraz, por Proyecto Maya: aproximación al método científico y Tesis doctorales ufológicas		2003 Premio Internacional Zurich: Accésit a Diego Zúñiga (Chile) por El rol de la prensa escrita chilena en la difusión de creencias populares. Medios y cobertura del tema OVNI Premio Cuadernos de Ufología: El Centro Italiano Studi Ufologici, en la persona de Edoardo Russo. Fondo Ricardo Caruncho: Antonio González Piñeiro, por su trabajo sobre la bibliografía ufológica española.		2004 Premio Internacional Zurich: Milton Hourcade (Uruguay) por OVNIs, la agenda secreta. Premio Cuadernos de Ufología: El weblog Magonia, de Luis Alfonso Gámez.